No Ensino Secundário dos Salesianos de Manique são construídos ambientes que conduzem a uma aprendizagem eficaz e profunda, autêntica, relevante, personalizada, empírica, impulsionadora e desenhada pelos alunos e pelos professores.
A matriz curricular do Ensino Secundário integra as componentes do currículo nacional, tal como definido pelo Ministério de Educação. Os ambientes de aprendizagem são construtivos, autorregulados, contextualizados e colaborativos.
Os alunos que frequentam o Ensino Secundário nos Salesianos de Manique são os protagonistas das suas aprendizagens, num processo construtivo e não recetivo, apoiados por metodologias ativas, conectadas com a própria aprendizagem, trabalho individual, estudo do aluno e aprendizagem por receção.
Os Salesianos de Manique oferecem (para um mínimo de 26 alunos) as seguintes áreas de estudos no Ensino Secundário: